6 月份單細胞測序相關文獻共收集到 46 篇（IF>9），平均影響因子 21.595，文末列出文獻發表期刊、研究方向和技術平臺等信息，接下來看看其中 5 篇文章。

【標題】Notch 信號驅動滑膜成纖維細胞特性和關節炎病理
【平臺】10X
【期刊】Nature（IF=42.778）
【時間】2020-06

【摘要】滑膜是一種圍繞關節的間充質組織，主要由成纖維細胞組成，在類風濕關節炎中，滑膜組織經歷明顯的增生、發炎和浸潤，并損傷關節。近期顯示，亞層中的成纖維細胞亞群在類風濕性關節炎中大量的擴增，這與疾病活躍度有關。然而，這些成纖維細胞分化和擴展的分子機制尚不清楚。研究者確定 NOTCH3 信號在表達 THY1 的血管周圍的和亞內層成纖維細胞分化中起關鍵作用并發現 NOTCH3 信號驅動成纖維細胞的轉錄及自從血管內皮細胞向外方向的空間梯度分布。在活動性類風濕關節炎中，滑膜成纖維細胞中的 NOTCH3 和 Notch 靶基因明顯上調。在小鼠中，敲除 Notch3 基因或使用抗體阻斷 NOTCH3 信號能夠緩解炎癥，防止炎癥性關節炎的關節損傷。這些結果表明滑膜成纖維細胞的位置特性（positional identity）受到內皮細胞來源的 Notch 信號調節，而這種由基質間的信號互作正是炎癥性關節炎中的炎癥來源和病理學基礎。

【標題】利用多能干細胞制造人類皮膚

【期刊】Nature（IF=42.778）

【平臺】10X

【時間】2020.06

【摘要】整個皮膚系統由皮膚和它的各種附屬結構（如毛囊、汗腺和指甲）組成，對于體溫調節、體液保持、外部壓力的抵御、觸覺和痛覺的調節等多種過程至關重要。在體外培養和生物工程移植物中重建攜帶附屬結構的人類皮膚仍然是一項亟待解決的生物醫學難題。此研究報道了類器官體培養系統，該系統從人的多能干細胞中產生復雜的皮膚。研究人員使用轉化生長因子 β（TGFβ）和成纖維細胞生長因子（FGF）信號途徑的逐步調節，從而在球形細胞聚集體中誘導出顱上皮細胞和神經嵴細胞。在 4 到 5 個月的培養中，研究人員觀察到類似囊腫的皮膚類器官體出現，該類器官體由分層的表皮、富含脂肪的真皮以及有皮脂腺的色素性毛囊組成。感覺神經元和雪旺氏細胞網絡形成神經樣束，以類器官體毛囊中的默克爾細胞為靶標，模仿與人類觸摸相關的神經回路。單細胞 RNA 測序和與胎兒標本的直接比較表明，在發育的中期，皮膚類器官體與人類胎兒的面部皮膚相同。此外，研究者表明，皮膚類器官體被移植到裸鼠上時會形成平坦的有毛皮膚。總之，這些結果表明，幾乎完整的皮膚可以在體外自我組裝，并可以在體內重建皮膚。研究者預計這一皮膚類器官體將為人類皮膚發育、疾病建模和重建手術奠定基礎。

【標題】腫瘤免疫治療誘導結腸炎癥的分子途徑

【期刊】Cell (IF=38.637)

【時間】2020-06-25

【摘要】研究顯示，用 PD- 1 和 CTLA- 4 抑制受體的特異性抗體阻斷檢查點，可以在多種人類癌癥中誘發持久的反應。然而，至今為止，我們對于負責嚴重炎癥副作用的免疫學機制仍然知之甚少。此研究報告了結腸炎中免疫細胞群的全面單細胞分析，結腸炎是檢查點阻斷的常見和嚴重的副作用。研究者觀察到具有高度細胞毒性和增殖狀態的 CD8 T 細胞的驚人積累，而沒有調節性 T 細胞耗竭的證據。T 細胞受體（TCR）序列分析表明，結腸炎相關的 CD8 T 細胞有相當一部分來源于組織駐留的細胞，這解釋了治療開始后結腸炎癥狀經常提前出現的原因。研究分析還發現了細胞因子、趨化因子和表面受體，它們可以作為結腸炎和檢查點阻斷的其他潛在炎癥副作用的治療靶點。

【標題】COVID-19 嚴重程度與氣道上皮 - 免疫細胞相互作用相關

【平臺】10X

【期刊】Nat Biotechnol (IF=36.558)

【時間】2020.06.26

【摘要】為了研究與 2019 嚴重冠狀病毒病（COVID-19）相關的免疫應答和機制，研究者對 19 名臨床特征明確的中度或重癥患者以及五個健康對照的鼻咽和支氣管樣本進行了單細胞 RNA 測序。研究人員確定了易受嚴重急性呼吸系統綜合癥冠狀病毒 2（SARS-CoV-2）感染的氣道上皮細胞的類型和狀態。在患有 COVID-19 的病人中，上皮細胞的 SARS-CoV- 2 受體 ACE2 的表達平均增加了三倍，這與免疫細胞的干擾素信號相關。與中度病例相比，危重病例表現出的上皮細胞與免疫細胞之間的相互作用更強，比如配體 - 受體表達譜和活化的免疫細胞，這其中包括表達 CCL2、CCL3、CCL20、CXCL1、CXCL3、CXCL10、IL8、IL1B 以 TNF 的炎性巨噬細胞。與中度病例相比，危重病例的轉錄差異可能促進了臨床觀察到炎性組織損傷、肺損傷和呼吸衰竭加劇。這些數據表明，CCR1 和 / 或 CCR5 途徑的藥理抑制作用可能會抑制重癥 COVID-19 中的免疫過度活化。