伯豪生物公司樣本中心采用 LIMS 系統進行樣本全程管理，年分析樣本 30000 多例，經過十年的經驗積累，平臺已經掌握對大多數物種、類型 RNA 的抽提方法 - 如人（新鮮組織，胸水，全血，血清，血漿，石蠟片，顯微切片組織），RNA 或 DNA 產量、純度和完整性是確保下游研究應用（微陣列芯片、新一代測序，Real-Time PCR 等）中獲得高質量數據的關鍵。
一、生物樣品儲存
伯豪生物充足的樣本儲存空間，實時監控，專人管理，嚴格的樣本接收、返還、銷毀 SOP，確保客戶樣本資源得到很好的管理和保護。
二、生物樣品提取
伯豪生物引進了無 RNA 酶污染的組織粉碎系統，采用一次性的勻漿頭和勻漿管，以避免樣品處理過程中的污染。針對不同物種、類型，選用相應的 SOP 進行樣本的抽提。
三、生物樣品分析
伯豪生物采用了 NanoDrop 和 Agilent 2100 核酸質檢系統進行樣品質檢工作。該系統僅需微量的 RNA 樣品，就能將樣品的濃度、質量等信息測定，更能將其所測得的數據信息模擬成凝膠電泳圖，給人以清晰直觀的效果。上海伯豪的所有 RNA 樣品均采用 Agilent 2100 系統質檢，跟傳統凝膠電泳方法相比較，結果更可靠，更利于保存和比較。
伯豪生物經過十年的經驗積累，平臺已經掌握對大多數物種、類型 RNA 的抽提方法 - 如人（新鮮組織，胸水，全血，血清，血漿，石蠟切片，顯微切割組織，穿刺樣本等）、小鼠、羊、牛、兔子、雞、斑馬魚、線蟲、水稻、擬南芥、甘蔗、種子、小麥、油菜、大腸桿菌、枯草桿菌、天藍色鏈霉菌、豬鏈球菌等，以及全血、組織中 DNA 的抽提方法。針對不同物種、類型選擇相應的抽提方法，并幫助客戶選擇穩定的試劑進行抽提，確保 RNA/DNA 的總量及質量滿足后續的實驗要求。
Agilent 2100 RNA 質檢部分實例（來源：2011 年）：
伯豪生物定制了天梭 TS10000 高性能集群，該集群在設計上專注于提高 HPC 應用的運行效率，增強系統的可擴展性，致力于提升系統的總體的計算能力、加速節點間的數據交換和系統的 I / O 帶寬。同時伯豪生物還根據實際運算需求，開發了不同級別的軟件應用，促進系統內部服務器、存儲、應用之間趨近于協同運算。伯豪生物生信分析平臺整體硬件設計采用了“高性能計算節點 + 高速網絡 + 高效能存儲”的整套定制方案。并開發了 SBC Analysis System（SAS 系統）等基于 web 頁的在線生物芯片自助分析系統，伯豪生物為客戶提供一站式生物信息解決方案。
四、生信分析（硬件設備）：
伯豪生物提供“高性能計算節點 + 高速網絡 + 高效能存儲”的整套解決方案
上海伯豪生物技術有限公司（以下簡稱“伯豪生物”）根據自身基因組學服務的需要定制了天梭 TS10000 高性能集群，共由 20 個節點和 1 個存儲構成，儲存能力達到 150TB，計算能力超過 1.8 億次每秒以上。伯豪生物在該集群設計上專注于提高 HPC 應用的運行效率，增強系統的可擴展性，致力于提升系統的總體計算能力、加速節點間的數據交換和系統的 I / O 帶寬。同時，伯豪生物還根據實際運算需求，開發了不同級別的軟件應用，促進系統內部服務器、存儲、應用之間趨近于協同運算。
伯豪生物生信分析平臺整體硬件設計采用了“高性能計算節點 + 高速網絡 + 高效能存儲”的整套定制方案。伯豪生物生信分析平臺計算節點采用的是基于 Intel? 至強？5500 處理器的浪潮 NF5220 和四路六核服務器 NF520D2。伯豪生物生信分析平臺集群不只計算性能高，還具有高擴展、低功耗的特點，由于采用了智能功耗控制技術，該集群整體功耗比同類產品至少降低 10%，在任務較少時，還可以通過浪潮天梭監管軟件遠程關閉沒有工作的節點，進一步節能減耗。
五、生信分析（軟件分析）
伯豪生物提供商業化和自主開發相結合的微陣列芯片生物信息分析綜合解決方案。
伯豪生物信息平臺的軟件系統采用商業化和自主開發相結合的方式建立了微陣列芯片數據分析綜合解決方案，可針對表達譜芯片、miRNA 芯片、SNP 芯片、DNA 甲基化芯片、CGH 芯片等提供各種伯豪生物個性化服務。
同時，伯豪生物還針對（臨床、科研）工作者的工作需要：“ 開發向伯豪用戶開放的個性化實時在線分析系統—Shbio Analysis System，SAS 系統”。【文字直達】
伯豪生物（SBC Analysis System，SAS 系統） 該系統核心算法基于 R 語言（R-software) 程序包，可以完成大部分的表達譜分析運算，伯豪生物 （SBC Analysis System，SAS 系統） 系統本地整合 8 大公共數據庫，實現對多個數據庫的交叉查詢，幫助您發現實驗揭示的生物學意義。
伯豪生物（SBC Analysis System，SAS 系統）屬于互聯網 在線分析系統，將幫助廣大 （臨床、科研） 工作者表達譜芯片進行各類統計學分析和功能注釋工作。伯豪生物在線分析系統的這些分析包括：“差異倍數計算（Fold Change)，t 檢驗（t-Test），SAM 檢驗（Significant Analysis of Microarray, SAM)，一維方差分析（one-way ANOVA)，二維方差分析（two-way ANOVA)，相關性分析（Correlation analysis)，聚類分析（Unsupervised hierarchical clustering)，主成份分析（Principal Component Analysis，PCA)，GO 富集分析（GO enrichment analysis），pathway 富集分析（Pathway enrichment analysis)，microRNA 檢索，蛋白質相互作用檢索（protein interaction) 等。”
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